Μια πρόσφατη μεταγονιδιωματική μελέτη αποκάλυψε ένα αξιοσημείωτα ποικίλο φάσμα ιών και βακτηρίων που μεταφέρονται από τρωκτικά στην επαρχία Heilongjiang, συμπεριλαμβανομένου του ιού Lassa, του ιού Amur, της Salmonella και του Yersinia pestis.
Η έρευνα χρησιμοποίησε τοΚιτ εμπλουτισμού RNA παθογόνων από την Macro & Micro-Test, βασισμένο στην τεχνολογία σύλληψης ανιχνευτών. Με την επιλεκτική εξάντληση του rRNA του ξενιστή και άλλων διατηρημένων θραυσμάτων ξενιστή, η μέθοδος διατήρησε αποτελεσματικά το μικροβιακό RNA, βελτιώνοντας σημαντικά την ευαισθησία ανίχνευσης παθογόνων. Αυτό το βήμα εμπλουτισμού του RNA των παθογόνων ήταν κρίσιμο για την επίτευξη υψηλού ποσοστού ανίχνευσης και παρείχε ισχυρή τεχνική υποστήριξη για την επιτήρηση των παθογόνων.
Τρωκτικά: Βασικές Δεξαμενές Ζωονόσων
Τα τρωκτικά είναι η πιο πλούσια σε είδη και ευρέως διαδεδομένη ομάδα θηλαστικών, που περιλαμβάνει περισσότερα από 2.000 είδη παγκοσμίως και αντιπροσωπεύουν πάνω από το 40% όλων των ειδών θηλαστικών.
Πέρα από την οικολογική τους σημασία, τα τρωκτικά χρησιμεύουν ως κύριες δεξαμενές και φορείς πολυάριθμων ζωονόσων παθογόνων.Επειδή τα ενδιαιτήματα των τρωκτικών συχνά επικαλύπτονται με τα ανθρώπινα περιβάλλοντα —μέσω άμεσων δαγκωμάτων, επαφής με περιττώματα ή έμμεσης μετάδοσης μέσω ψύλλων και ακάρεων— τα παθογόνα που φιλοξενούν αποτελούν επίμονες απειλές για τη δημόσια υγεία.
Αξίζει να σημειωθεί ότι περισσότερο από το 70% των αναδυόμενων μολυσματικών ασθενειών προέρχονται από την άγρια ζωή, με τα τρωκτικά να αποτελούν μία από τις σημαντικότερες δεξαμενές μετάδοσης ιών.
Περιοχή Συνόρων Χεϊλονγκτζιάνγκ: Μια Πρώτη Γραμμή για την Επιτήρηση Παθογόνων
Η Χεϊλονγκτζιάνγκ, μια παραμεθόρια επαρχία στη βορειοανατολική Κίνα, διαθέτει άφθονους οικολογικούς πόρους και συνορεύει με πολλές χώρες. Ο συνδυασμός της πλούσιας βιοποικιλότητας και της συχνής διασυνοριακής μετακίνησης πληθυσμού δημιουργεί ευνοϊκές συνθήκες για τη μετάδοση παθογόνων.
Μεταξύ Ιουνίου και Ιουλίου 2021, οι ερευνητές συνέλεξαν 67 άγρια τρωκτικά από την πόλη Hengdaohezi, στην πόλη Mudanjiang. Τα δείγματα περιελάμβαναν:
l 20Απόδημος χερσόνησος
l 47Myodes rufocanus
Όλα τα δείγματα συλλέχθηκαν σε κατοικημένες περιοχές και στις γύρω γεωργικές εκτάσεις, υπογραμμίζοντας τη στενή διεπαφή μεταξύ των ανθρώπινων οικισμών και των οικοτόπων άγριας ζωής.
Τεχνολογία εμπλουτισμού παθογόνων: Υπερνίκηση της παρεμβολής υποβάθρου ξενιστή
Στην μεταγονιδιωματική αλληλούχιση, το RNA του ξενιστή συνήθως κυριαρχεί στις αναγνώσεις αλληλούχισης, καλύπτοντας σήματα παθογόνων χαμηλής αφθονίας.
Για την αντιμετώπιση αυτής της πρόκλησης, η μελέτη χρησιμοποίησεΚιτ ανίχνευσης μεταγονιδιωματικών παθογόνων της Macro & Micro-Test. Χρησιμοποιώντας τεχνολογία σύλληψης ανιχνευτών, ειδικά σχεδιασμένοι ανιχνευτές συνδέονται με το rRNA του ξενιστή και τις διατηρημένες αλληλουχίες, επιτρέποντας την εξάντλησή τους και έτσι τον εμπλουτισμό του μικροβιακού RNA.
Αυτή η προσέγγιση βελτίωσε σημαντικά την ευαισθησία ανίχνευσης παθογόνων, επιτρέποντας στην κατάντη αλληλούχιση να ανακτήσει ένα υψηλότερο ποσοστό αναγνώσεων παθογόνων. Το βήμα εμπλουτισμού έθεσε μια σταθερή βάση για τον ακριβή χαρακτηρισμό του φάσματος παθογόνων που μεταφέρουν τα τρωκτικά.
Μετά τον εμπλουτισμό, τα δείγματα RNA υποβλήθηκαν σε αντίστροφη μεταγραφή, κατασκευή βιβλιοθήκης και αλληλούχιση υψηλής απόδοσης. Η βιοπληροφορική ανάλυση περιελάμβανε:
l Φιλτράρισμα γονιδιώματος ξενιστή
l Ταξινομική ταξινόμηση χρησιμοποιώντας Kraken2
l Διόρθωση αφθονίας με Bracken
Αυτή η ροή εργασίας δημιούργησε ένα ολοκληρωμένο προφίλ των ιικών και βακτηριακών κοινοτήτων.
Ευρήματα Έρευνας: Συν-κυκλοφορία Πολλαπλών Ιών και Βακτηρίων
Ιικά ευρήματα
Οι ιοί που εντοπίστηκαν ανήκαν σε 21 οικογένειες ιών, συμπεριλαμβανομένωνArenaviridaeκαιΧανταβιίδες.
Διά μέσουde novoΜε τη συναρμολόγηση χρησιμοποιώντας το Megahit, δημιουργήθηκαν 154 ιικά contigs, εκ των οποίων τα 110 ευθυγραμμίστηκαν με 19 ιούς από οκτώ οικογένειες.
In Απόδημος χερσόνησος, εντοπίστηκαν οι ακόλουθοι ιοί:
l Arenaviruses: Ιός Lassa, ιός Wenzhou, ιός Gairo
l Hantaviruses: Ιός Amur, ιός Puumala
In Myodes rufocanus, Ανιχνεύθηκαν αρτηριοϊός αρουραίου και ιός Amur.
Μεταξύ αυτών των παθογόνων:
Ο ιός Lassa είναι ένας αιτιολογικός παράγοντας του ιογενούς αιμορραγικού πυρετού, με ποσοστά θνησιμότητας που φτάνουν περίπου το 20%.
Ο ιός Amur είναι ένα από τα παθογόνα που ευθύνονται για τον αιμορραγικό πυρετό με νεφρικό σύνδρομο (HFRS). Η Κίνα αναφέρει το υψηλότερο παγκόσμιο φορτίο λοιμώξεων από ιό hantavirus.
Βακτηριακά ευρήματα
Συνολικά σχολιάστηκαν 1.051 βακτηριακά γένη.
Τα πιο άφθονα γένη ήταν:
μεγάλοΣαλμονέλα(26–31%)
μεγάλοΓερσίνια(11–23%)
Σαλμονέλαείναι ένα σημαντικό παθογόνο που μεταδίδεται μέσω των τροφίμων, υπεύθυνο για περίπου 9 εκατομμύρια κρούσματα τυφοειδούς πυρετού και περίπου 110.000 θανάτους ετησίως παγκοσμίως.
Yersinia pestis, ο αιτιολογικός παράγοντας της πανώλης, ευθύνεται για τρεις ιστορικές πανδημίες. Η επαρχία Χεϊλονγκτζιάνγκ αναγνωρίζεται ως μία από τις φυσικές εστίες πανώλης της Κίνας και παραμένει περιοχή προτεραιότητας για την επιτήρηση της πανώλης.
Σημασία της Μελέτης
Επιστημονικές Συνεισφορές
Αυτή η μελέτη αντιπροσωπεύει την πρώτη αναφορά θραυσμάτων ιού Lassa και ιού αρτηρίτιδας αρουραίου σε τρωκτικά από το Heilongjiang, επεκτείνοντας τη βάση δεδομένων παθογόνων που μεταδίδονται από τρωκτικά στην Κίνα.
Χαρακτηρίζει συστηματικά τις ιογενείς και βακτηριακές κοινότητες σε τοπικούς πληθυσμούς τρωκτικών, παρέχοντας βασικά δεδομένα για την επιτήρηση των ζωονόσων σε παραμεθόριες περιοχές.
Επιπτώσεις στη Δημόσια Υγεία
Τα ευρήματα υπογραμμίζουν την ανάγκη για συνεχή επιτήρηση και έλεγχο παθογόνων παραγόντωνA. χερσονήσουςκαιΜ. rufocanus.
Τα δεδομένα παρέχουν επιστημονικά στοιχεία που υποστηρίζουν στρατηγικές ελέγχου της πηγής για ασθένειες όπως η πανώλη και ο αιμορραγικός πυρετός με νεφρικό σύνδρομο.
Μεθοδολογικά Πλεονεκτήματα
Η μεταγονιδιωματική αλληλούχιση επιτρέπει την αμερόληπτη ανίχνευση τόσο γνωστών όσο και νέων παθογόνων.
Σε αυτήν τη μελέτη, η τεχνολογία εμπλουτισμού παθογόνων της Macro & Micro-Test επέδειξε ισχυρή απόδοση, ενισχύοντας αποτελεσματικά την ανίχνευση παθογόνων-στόχων σε σύνθετα βιολογικά δείγματα. Τα αποτελέσματα επιβεβαιώνουν την ικανότητά της να υποστηρίζει την ταυτοποίηση παθογόνων υψηλής ευαισθησίας στην επιτήρηση της άγριας ζωής.
Σύσταση προϊόντος
Με βάση την επιτυχημένη εφαρμογή του σε αυτήν τη μελέτη, το κιτ εμπλουτισμού RNA παθογόνων μακροεντολών και μικροδοκιμών συνιστάται ιδιαίτερα για την έρευνα μεταγονιδιωματικής επιτήρησης.
Με την αποτελεσματική εξάντληση των νουκλεϊκών οξέων του ξενιστή και τον εμπλουτισμό των μικροβιακών αλληλουχιών, το κιτ βελτιώνει σημαντικά την ευαισθησία ανίχνευσης και την ποιότητα των δεδομένων. Αποτελεί ένα απαραίτητο εργαλείο για την ακριβή ανακάλυψη παθογόνων σε σύνθετα δείγματα και παρέχει ισχυρή τεχνική υποστήριξη για την επιτήρηση της δημόσιας υγείας, την αξιολόγηση του ζωονόσου και την ετοιμότητα για επιδημίες.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Ώρα δημοσίευσης: 02 Μαρτίου 2026