Ένα νέο όπλο για τη διάγνωση της φυματίωσης και την ανίχνευση αντοχής στα φάρμακα: μια νέα γενιά στοχευμένη αλληλουχία (TNGS) σε συνδυασμό με τη μηχανική μάθηση για τη διάγνωση της υπερευαισθησίας της φυματίωσης
Έκθεση βιβλιογραφίας: CCA: Ένα διαγνωστικό μοντέλο που βασίζεται σε TNG και μηχανική μάθηση, η οποία είναι κατάλληλη για άτομα με λιγότερη βακτηριακή φυματίωση και φυματιώδη μηνιγγίτιδα.
Τίτλος διατριβής: Tuberculous-στοχευμένη αλληλουχία επόμενης γενιάς και μηχανική μάθηση: Μια εξαιρετικά ευαίσθητη διαγνωστική στρατηγική για την εμμηνιαία πνευμονική σωληνοειδή και τη σωληνωτή μηνιγγίτιδα.
Περιοδικό: 《Clinica Chimica Acta》
Εάν: 6.5
Ημερομηνία δημοσίευσης: Ιανουάριος 2024
Σε συνδυασμό με το Πανεπιστήμιο της Κινεζικής Ακαδημίας Επιστημών και το Πεκίνο Νοσοκομείο Ιατρικού Πανεπιστημίου Capital Medical University, το Macro & Micro-Test δημιούργησε μοντέλο διάγνωσης φυματίωσης με βάση τη νέα γενιά τεχνολογίας στοχευμένης αλληλουχίας (TNGS) και τη μέθοδο εκμάθησης μηχανών, η οποία παρείχε εξαιρετικά υψηλή Η ευαισθησία ανίχνευσης για τη φυματίωση με λίγα βακτήρια και τη φυματιώδη μηνιγγίτιδα, παρείχε μια νέα μέθοδο διάγνωσης υπερευαισθησίας για την κλινική διάγνωση δύο τύπων της φυματίωσης και βοήθησε την ακριβή διάγνωση, την ανίχνευση αντοχής στα φάρμακα και τη θεραπεία της φυματίωσης. Ταυτόχρονα, διαπιστώνεται ότι το cfDNA του πλάσματος του ασθενούς μπορεί να χρησιμοποιηθεί ως κατάλληλος τύπος δείγματος για κλινική δειγματοληψία στη διάγνωση του TBM.
Σε αυτή τη μελέτη, χρησιμοποιήθηκαν 227 δείγματα πλάσματος και δείγματα εγκεφαλονωτιαίου υγρού για τη δημιουργία δύο κλινικών ομάδων, στα οποία χρησιμοποιήθηκαν τα δείγματα της εργαστηριακής διαγνωστικής κοόρτης για την καθιέρωση του μοντέλου μηχανικής μάθησης της διάγνωσης της φυματίωσης και τα κλινικά δείγματα διαγνωστικής ομάδας χρησιμοποιήθηκαν για να επαληθεύσουν τα καθιερωμένα Διαγνωστικό μοντέλο. Όλα τα δείγματα στοχεύθηκαν πρώτα από μια ειδικά σχεδιασμένη στοχευμένη πισίνα ανιχνευτή σύλληψης για το Mycobacterium tuberculosis. Στη συνέχεια, με βάση τα δεδομένα αλληλουχίας TB-TNGS, το μοντέλο δέντρου αποφάσεων χρησιμοποιείται για την εκτέλεση 5-φορές διασταυρούμενης επικύρωσης στα σύνολα εκπαίδευσης και επικύρωσης της εργαστηριακής διαγνωστικής ουράς και τα διαγνωστικά όρια των δειγμάτων πλάσματος και των δειγμάτων του εγκεφαλονωτιαίου υγρού. Το ληφθέντα κατώφλι μεταφέρεται σε δύο δοκιμαστικά σύνολα ουράς κλινικής διάγνωσης για ανίχνευση και η διαγνωστική απόδοση του εκπαιδευόμενου αξιολογείται με καμπύλη ROC. Τέλος, ελήφθη το μοντέλο διάγνωσης φυματίωσης.
Εικ. 1 Σχηματικό διάγραμμα του σχεδιασμού της έρευνας
Αποτελέσματα: Σύμφωνα με τα συγκεκριμένα κατώτατα όρια του δείγματος DNA CSF (AUC = 0,974) και του δείγματος cfDNA πλάσματος (AUC = 0,908) που προσδιορίστηκε σε αυτή τη μελέτη, μεταξύ 227 δειγμάτων, η ευαισθησία του δείγματος CSF ήταν 97,01%, η εξειδίκευση ήταν 95,65%και Η ευαισθησία και η ειδικότητα του δείγματος πλάσματος ήταν 82,61% και 86,36%. Στην ανάλυση 44 ζευγαρωμένων δειγμάτων CFDNA πλάσματος και εγκεφαλονωτιαίου υγρού DNA από ασθενείς με TBM, η διαγνωστική στρατηγική αυτής της μελέτης έχει υψηλή συνοχή 90,91% (40/44) στο πλάσμα CFDNA και το εγκεφαλονωτιαίο ϋΝΑ και η ευαισθησία είναι 95,45% (42/44). Σε παιδιά με πνευμονική φυματίωση, η διαγνωστική στρατηγική αυτής της μελέτης είναι πιο ευαίσθητη στα δείγματα πλάσματος από τα αποτελέσματα ανίχνευσης Xpert των δειγμάτων γαστρικού χυμού από τους ίδιους ασθενείς (28,57% έναντι 15,38%).
Εικόνα 2 Ανάλυση απόδοσης του μοντέλου διάγνωσης φυματίωσης για δείγματα πληθυσμού
